Žiga Avsec
也称 Ziga Avsec / Avsecz
Google DeepMind 研究员,领导 AlphaGenome 序列模型研究,用 DNA 序列预测基因调控和变异效应。
个人介绍
Žiga Avsec 是 Google DeepMind 的研究员,在伦敦从事基因组学方向的序列模型研究。他是 2026 年 1 月《Nature》论文 AlphaGenome 的第一作者和通讯作者,论文写明他领导该项目。该模型接收 100 万碱基的 DNA 序列,预测基因表达、剪接、染色质可及性等多种功能基因组轨迹,并用于变异效应评估。同年 11 月 11 日,他与 Adam Gayoso、Natasha Latysheva、Pushmeet Kohli 等人发布 AlphaGenome 2,把模型改成按组织、细胞类型或细胞状态分别预测,训练数据包含超过 1.07 亿个单细胞图谱。
更早的工作包括 2021 年在《Nature Methods》发表的 Enformer:该模型用 Transformer 从更长的 DNA 序列预测基因表达,研究与 Calico 合作完成;以及同年在《Nature Genetics》发表的 BPNet。2023 年,他还是《Science》上 AlphaMissense 的共同作者,该模型用于预测错义变异的致病性。2021 年 BPNet 论文的署名机构包括 DeepMind、慕尼黑工业大学信息学系,以及慕尼黑大学定量生物科学研究生院。